Periode AKL (Akademi Kesehatan Lingkungan)

Berdasarkan Keputusan Menteri Kesehatan RI. Nomor 232/MENKES/SK/IV/1997 tanggal 10 April 1997 tentang Pembentukan 6 (enam) Akademi Kesehatan Lingkungan di Lingkungan Departemen Kesehatan, maka PAM-SKL Depkes Purwokerto berubah nama menjadi AKL Depkes Purwokerto. AKL Depkes Purwokerto dipimpin oleh seorang direktur dengan dibantu oleh tiga orang pembantu direktur. Pada periode ini pimpinan dijabat oleh S Purwanto, MSc, kemudian digantikan oleh Saring Soewarto, SH, SKM (sebagai Plh).

Saring Soewarto, SH, SKM digantikan oleh Hary Widodo, MSc. Hary Widodo, MSc diberhentikan sebelum habis masa jabatannya dan digantikan oleh : dr Hartanto (sebagai Pgs) dan Sujoto Hernady, MSc (Sebagai Plh).